5 zautomatyzowanych programów do kariotypowania do mapowania chromosomów

ArgusSoft to świetna opcja oprogramowania, która pozwala automatycznie kariotypować ludzkie chromosomy według pozycji pasma, a także może być używana do kariotypowania chromosomów zwierząt i roślin online.

Kluczowe cechy:

• Barwienie G, Q, R
• Zautomatyzowane kariotypowanie ludzkich chromosomów z rozpoznawaniem zagięć
• Zautomatyzowane kariotypowanie chromosomów świni
• 3 wbudowane bazy standardowych ideogramów ludzkich chromosomów o różnych poziomach jasności – 400, 550 i 850 poziomów
• Może dodawać podstawy standardowych ideogramów kromosomów dla innych gatunków zwierząt i roślin
• Metody przygotowania próbek
• Wprowadzanie obrazów płyt metafazowych za pomocą kamery i skanera
• Towarzyszące obrazowi z grafiką
• Zautomatyzowany podział zastosowanych i stykających się chromosomów
• Porównanie chromosomów i ideogramów

Możesz również użyć ArgusSoft do trenowania systemu rozpoznawania chromosomów za pomocą wstępnie ustawionych preparatów, możesz przenosić obrazy płytek metafazowych i kariogramy we wbudowanej bazie danych, może tworzyć wzory raportów, korygować kariogramy, a także przechowywać i drukować obrazy i analizy wyniki.

Możesz uzyskać szkolenie i wsparcie dotyczące korzystania z ArgusSoft od ich oficjalna strona internetowa. Centrum wsparcia obejmuje usługi szkoleniowe, konserwacyjne i doradcze.

⇒Wypróbuj ArgusSoft

HiBand to oprogramowanie stworzone przez Applied Spectral Imaging, które może przeprowadzać zaawansowaną analizę chromosomów za pomocą funkcji cyfrowego kariotypowania.

Oprogramowanie to wykorzystuje zautomatyzowane funkcje skanowania do dogłębnej analizy struktury chromosomów.

Możesz korzystać z szerokiej gamy funkcji dostępnych w HiBand do indeksowania, liczenia, przechowywania i zarządzania danymi wyników. Możesz także użyć tego potężnego oprogramowania do automatycznego skanowania sekwencji chromosomów.

Wyniki uzyskane przy użyciu funkcji kariotypowania znalezionych w HiBand mogą być przechowywane w bezpiecznym miejscu z warstwami chronionymi hasłem i zaszyfrowanymi.

Zapewnia to spokój ducha w przypadku utraty ważnych danych sekwencjonowania, a dzięki temu poprawia również wydajność laboratorium.

Sortowanie wyników odbywa się w bardzo prosty sposób, wystarczy poszukać określonej sekwencji chromosomów i wszystkie wyniki są wyświetlane na dobrze zorganizowanym ekranie, który oferuje łatwy dostęp do modyfikowania, przeglądania, a także dodawania tagów do dowolnego akta.

Kluczowe cechy:

• Brightfield Kariotypowanie-G-Band i R-Band
• Kariotypowanie fluorescencyjne-Q-Band, R-Band i FISH
• Kariotypowanie spektralne
• Automatyczne liczenie chromosomów
• Indeksowanie i klasyfikacja chromosomów
• Zaawansowana separacja chromosomów i zaawansowane wzmocnienie obrazu
• Galeria obrazów – może prezentować wszystkie metafazy przypadków i kariotypy na jednym ekranie
• Potrafi porównać chromosomy – zobacz je obok siebie
• Abberant Ideogram – w generatorze obrazów możesz dodawać chromosomy, komórki, ideogramy i adnotacje

HiBand wykorzystuje w pełni zautomatyzowane przepływy pracy w celu zwiększenia wydajności laboratorium, ma start i spacer funkcje skanowania, znajduje metafazy, automatycznie odczytuje kody kreskowe, przesyła obrazy w czasie rzeczywistym podczas skanowania slajdów, a także eksportuje do centralnego portalu i bazy danych LIS laboratorium.

⇒Wypróbuj HiBand

Ten system do kariotypowania ma bardzo intuicyjny interfejs użytkownika, który oferuje wszystkie funkcje na jednym ekranie. Pozwala to na łatwy i szybki dostęp do wszystkich uzyskanych informacji.

Ikaros może być używany z Neon, która jest platformą zaprojektowaną do pomocy w organizacji danych obrazu i spraw.

Neon zbiera dane ze wszystkich prac obrazowania, źródeł zewnętrznych i umożliwia ich prezentację w łatwy do zrozumienia sposób za pomocą pulpitu zarządzania sprawami.

To narzędzie pozwala zawsze mieć pod ręką ważne informacje i przechowywać je w bezpieczny sposób, ale wykorzystuje bardzo silne dane algorytmy zarządzania, ma fajny wachlarz sposobów na obserwację danych i może zapewnić konkretne wyszukiwania oparte na słowach kluczowych i danych cechy.

Sprawdź więcej informacji o Neon i jego funkcjach tutaj.

Ikaros obsługuje wiele różnych technik bandingowych – Brightfield G-Band i R-Band, Fluorescence Q-Band, R-Band i FISH – oferuje wiele wstępnie zdefiniowanych form kariogramu dla ludzi, roślin i zwierząt.

Możesz łatwo edytować te formularze, aby dodać wszelkie dane wymagane do rodzaju prowadzonych badań.

Fakt, że możesz porównywać chromosomy według klas lub kariogramów, dostarcza bardzo przydatnych informacji, które pozwalają łatwo zidentyfikować różnice.

⇒Wypróbuj Ikarosa

MetaClass to świetne oprogramowanie do kariotypowania, zaprojektowane w sposób modułowy. To oprogramowanie pomaga w wykonywaniu kariotypowania i badań chromosomów metodą FISH.

MetaClass składa się z następujących modułów:

• Baza danych metaklas

Baza danych, którą można zainstalować z dowolnym modułem MetaClass. Umożliwia przechowywanie danych pacjenta i zapewnia łatwy dostęp do wyników. Za pomocą tego modułu możesz tworzyć niestandardowe raporty w dowolnym języku.

• Kariotypowanie metaklasy

Umożliwia badanie kariotypu po cyfrowym uchwyceniu obrazów etapu przygotowania metafazy i ułożenie ich w pary na podstawie rozmiaru, położenia itp.

Ten moduł zapewnia doskonałą jakość wyników, jeśli chodzi o pasma chromosomów, a także może dostarczyć profesjonalnie wyglądające raporty.

Najważniejsze cechy to:

• Badanie kariotypu jest analizowane przy powiększeniu 100X w jasnym polu
• Może uchwycić kilka obrazów metafazowych
• Jakość obrazu można modyfikować, aby uzyskać bardziej wyraziste wyniki
• Automatyczna klasyfikacja chromosomów
• 4 widoki ekranu – okno Metafaza, Kariotyp i Niesklasyfikowane chromosomy
• Może wyświetlać prototypy chromosomów
• Chromosomy, które nie są sklasyfikowane, mogą być korygowane automatycznie lub ręcznie – nałożenie, separacja, skrzyżowania, rotacje itp.
• Pliki sesji MTC lub obrazy BMP można zapisywać i ponownie wczytywać w dowolnym momencie
• Może eksportować poszczególne chromosomy do bazy danych metaklasy z możliwością dodawania komentarzy i notatek

Metaklasa RYBA

Jest to moduł analizy, który umożliwia uzyskanie obrazu hybrydyzacji fluorescencyjnej IN SITU (FISH).

Moduł ten rejestruje obrazy za pomocą fluorescencyjnych sond DNA i pozwala na potwierdzenie nieprawidłowości genetycznych – trisomii, mikrodelecji, rearanżacji chromosomów itp.

Obrazy FISH są analizowane przy powiększeniu 100X i, dla szerszego zakresu przejrzystości obrazu, mogą również rejestrować obrazy z różnymi filtrami.

Jeśli chcesz dowiedzieć się więcej o modułach przedstawionych powyżej i innych funkcjach, możesz zajrzeć do Katalog MetaClass.

⇒Wypróbuj MetaClass

GenASis Bandview to kolejne świetne oprogramowanie do kariotypowania, które jest zbudowane z modułów o różnych możliwościach. Możesz używać tej aplikacji do wykonywania diagnostyki kariotypowej i uzyskiwania dokładnych wyników badań.

To oprogramowanie pozwala w pełni dostosować przepływ pracy i proces diagnozy, w zależności od potrzeb Twojej firmy i celów, które starasz się osiągnąć.

Szeroka gama narzędzi dostępnych w BandView jest łatwo dostępna za pomocą jednego kliknięcia myszy i oferuje potężne wrażenia z kariotypowania G/R/C/Q-Band. Możesz wybierać między zautomatyzowanym lub ręcznym przepływem pracy, jeśli chodzi o lokalizowanie metafaz i przechwytywanie obrazów.

Nieprawidłowości chromosomowe, jeśli zostaną wykryte, można zaobserwować poprzez dodanie, usunięcie lub rearanżację materiału genetycznego pacjenta. Dzięki BandView możesz wykorzystać technikę molekularną pasma FISH.

FISH wykorzystuje sondy fluorescencyjne do przyłączania się do różnych części chromosomu, umożliwiając oprogramowaniu wykrywanie i lokalizowanie nieprawidłowości występujących w określonych sekwencjach DNA.

⇒Wypróbuj GenASis Bandview

W tym artykule przyjrzeliśmy się jednemu z najlepszych programów do automatycznego kariotypowania, które istnieją na rynku pod koniec 2021 roku.

Opcje oprogramowania do kariotypowania omówione w tym artykule oferują szereg funkcji, które pomogą Ci osiągnąć cele Twojej firmy.

Korzystając z tego typu oprogramowania, możesz szybko policzyć tysiące struktur chromosomów, analizować za pomocą różnych profesjonalne techniki i tworzyć wysokiej jakości raporty, które pozwolą Ci zidentyfikować wszelkie nieprawidłowości za pomocą łatwość.

Chcielibyśmy dowiedzieć się, jaka jest Twoja opinia na temat oprogramowania, które przedstawiliśmy na tej liście 5 najlepszych. Daj nam znać, korzystając z poniższej sekcji komentarzy.